Resmi Gazete'nin28 Ocak 2012 tarihli sayısında yayınlanan atama kararlarına göre Mustafa Yılmaz, Cumhurbaşkanı Abdullah Gül, Başbakan Recep Tayyip Erdoğan ve Sağlık Bakanı Recep Akdağ'ın imzalarıyla Sağlık Bakanlığı Müşavirliği’ne atandı.
Yılmaz, Haziran 2007 ile Eylül 2011 tarihleri arasında Ordu Özel İdare Genel Sekreterliği yapmıştı.
