Encü, 4 Kasım 2016'da Şırnak Cumhuriyet Başsavcılığı'nca hakkında yürütülen terör soruşturması kapsamında gözaltına alınmış, çıkarıldığı nöbetçi Sulh Ceza Hakimliği'nce tutuklanmıştı. Avukatlarının itirazı üzerine Encü'nün tahliyesine karar verilmiş ve önceki gün (15 Şubat) tutuklu bulunduğu Kandıra F Tipi Kapalı Cezaevi'nden tahliye edilmişti.