Kaza, Merkez Çarmuzu Mahallesi Kayalık mevkiindeki trenyolu hemzemin geçidinde meydana geldi. Malatya'dan Elazığ istikametine giden 5308 sayılı yük treni Hacı Kılıç'ın kullandığı 44 EE 747 plakalı otomobile hemzemin geçitte çarptı. Kaza'da sürücü Haci Kılıç ile otomobilde bulunan kızı Ayşegül Kılıç hayatını kaybetti. 
 
Kaza yerine gelen 112 görevlileri iki kişiyi de ölmüş olarak buldu. Bu arada, görgü tanığı bir vatandaş, ölenlerin komuşları olduğunu belirtip, kazayı görmediğini söyledi.  Tren'de görevli bir kişi ise, kendisinin ön tarafta olmadığını bu nedenle kazanın nasıl olduğunu görmediğini ifade edip, bir anda çarpma sesi gelip trenin daha sonra durduğunu belirtti.